Sydney Bristow lavora sotto copertura con suo padre, Jack Bristow per L'SD-6, un'organizzazione segreta che si occupa di spionaggio, estorsione, traffico d'armi, fingendosi una divisione della CIA. Sydney scopre di non aver mai lavorato per la CIA come sempre ha creduto, ma contro la CIA, quando trova il fidanzato (al quale aveva confessato la veritΰ sul suo lavoro segreto)assassinato nella vasca da bagno.Non sapendo a chi altri rivolgersi, Sydney chiede aiuto alla vera CIA allo scopo di eliminare definitivamente l'SD-6.